2026년도 2학기 합성생물학 컴퓨테이셔널 디자인 (분자트랙) (SYNB510-01) 강의계획서

1. 수업정보

학수번호 SYNB510 분반 01 학점 3.00
이수구분 전공필수 강좌유형 선수과목
포스테키안 핵심역량
강의시간 월, 수 / 08:00 ~ 09:15 / | 월, 수 / 08:00 ~ 09:15 / | 월, 수 / 08:00 ~ 09:15 / 성적취득 구분 G

2. 강의교수 정보

김상욱 이름 김상욱 학과(전공) 생명과학과
이메일 주소 sukim@postech.ac.kr Homepage http://sbi.postech.ac.kr
연구실 생물정보학 연구실 전화 279-2348
Office Hours

3. 강의목표

Part 1에서는 효소의 기능을 단백질 구조 측면에서 이해할 수 있도록, 단백질의 3차 구조 및 이를 구성하는 아미노산에 대한 기본지식과 구조 결정방법, 구조 분석 방법 등을 익힌다.
Part 2에서는 효소의 기질 특이성을 디자인하는 최신 방법론을 학습하여 합성생물학의 DBTL cycle에 맞춤형으로 실험 디자인을 도울 수 있는 computation 방법론을 익힌다.
또한 Part 3에서는 인공지능(AI)의 핵심 개념부터 이를 활용한 최신 단백질 구조예측 및 단백질 설계 기술에 대해 이론적 배경을 설명하고 방법론을 익숙하게 함으로써, 효소 설계와 합성생물학 연구에 필요한 통합적 이해와 활용 역량을 기르는 것을 목표로 한다.

4. 강의선수/수강필수사항

없음

5. 성적평가

중간고사 기말고사 출석 과제 프로젝트 발표/토론 실험/실습 퀴즈 기타 계
100 100
비고
실습과제평가1 : 30%
실습과제평가2 : 30%
실습과제평가3 : 40%

6. 강의교재

도서명 저자명 출판사 출판년도 ISBN

7. 참고문헌 및 자료

PPT slides

8. 강의진도계획

1주 : Introduction
2주 : 단백질의 3차 구조와 아미노산의 기본개념
3주 : 단백질 구조결정 방법 : 결정학 (X-ray crystallography) , 초저온전자현미경 (Cryo-electron microscopy), 구조예측 (Alphafold3)
4주 : 효소활성 측정법
5주 : PDB, ChimerX, Coot 기본활용법
6주 : 실습과제평가1 (단백질 구조 분석 툴 활용)
7주 : 단백질의 구조와 기능
8주 : 아미노산의 특징 과 서열 진화
9주 : 단백질 구조 예측과 효소 활성
10주 : 효소 활성 조절을 위한 디자인 방법론
11주 : 실습과제평가2 (효소 활성 조절 돌연변이 예측 툴 활용)
12주 : 인공지능 기초
13주 : AI 를 활용한 구조예측
14주 : 생성형 모델과 단백질 설계
15주 : AI 기반 단백질 설계의 응용
16주 : 실습과제평가 3 (단백질 구조 예측 툴 활용)

9. 수업운영

-강의 유형 : 온라인 교과

10. 학습법 소개 및 기타사항

11. 장애학생에 대한 학습지원 사항

- 수강 관련: 문자 통역(청각), 교과목 보조(발달), 노트필기(전 유형) 등

- 시험 관련: 시험시간 연장(필요시 전 유형), 시험지 확대 복사(시각) 등

- 기타 추가 요청사항 발생 시 장애학생지원센터(279-2434)로 요청

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