2022년도 2학기 현대생물학동향(차세대염기서열데이터의 생물정보학적분석) (LIFE622C-01) 강의계획서

1. 수업정보

학수번호 LIFE622C 분반 01 학점 3.00
이수구분 전공선택 강좌유형 강의실 강좌 선수과목
포스테키안 핵심역량
강의시간 월, 수 / 09:30 ~ 10:45 / 지곡연구동 강의실 [304호] 성적취득 구분 G

2. 강의교수 정보

김종경 이름 김종경 학과(전공) 생명과학과
이메일 주소 blkimjk@postech.ac.kr Homepage https://cb.postech.ac.kr/
연구실 전화 0542792353
Office Hours 월 17:00-18:00

3. 강의목표

본 강의에서는 생명과학 전공에 필수적인 차세대 염기서열 데이터의 생물정보학적 분석 방법론에 대하여 학습한다.

4. 강의선수/수강필수사항

없음.

5. 성적평가

중간고사 (30%), 기말고사 (30%), 과제물 및 프로젝트 (40%)

6. 강의교재

도서명 저자명 출판사 출판년도 ISBN

7. 참고문헌 및 자료

- Bioinformatics Data Skills, Vince Buffalo
- The Biostar Handbook: Bioinformatics Data Analysis Guide (https://www.biostarhandbook.com/)
- R for Data Science (http://r4ds.had.co.nz/)

8. 강의진도계획

1주: Essential skills for bioinformatics: Unix/Linux
2주: Essential skills for bioinformatics: Unix/Linux
3주: Essential skills for bioinformatics: Unix/Linux
4주: Essential skills for bioinformatics: Unix/Linux
5주: Next-generation sequencing technologies
6주: FASTA/FASTQ, Installing UNIX programs, Accessing SRA
7주: Sequence alignments, Aligners
8주: 중간고사
9주: RNA-seq: Introduction
10주: RNA-seq: QC
11주: RNA-seq: Alignment
12주: RNA-seq: Quantification
13주: RNA-seq: Differential analysis
14주: RNA-seq: Advanced analysis
15주: RNA-seq: Advanced analysis
16주: 기말고사

9. 수업운영

이론강의, 실습, 발표

10. 학습법 소개 및 기타사항

11. 장애학생에 대한 학습지원 사항

- 수강 관련: 문자 통역(청각), 교과목 보조(발달), 노트필기(전 유형) 등

- 시험 관련: 시험시간 연장(필요시 전 유형), 시험지 확대 복사(시각) 등

- 기타 추가 요청사항 발생 시 장애학생지원센터(279-2434)로 요청

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번호 학기명 학수번호 분반 강좌명